Tiến trình lập luận chẩn đoán lâm sàng là một vòng lặp liên tục, được chuẩn hóa qua 6 bước sau:
Bước 1: Xác định vấn đề lâm sàng (Triệu chứng chủ đạo và lý do đến khám)
                       │
                       ▼
Bước 2: Thiết lập phổ giả thuyết chẩn đoán sơ bộ
                       │
                       ▼
Bước 3: Thu thập thông tin lâm sàng bổ sung (Khai thác bệnh sử, thăm khám thực thể, yếu tố dịch tễ)
                       │
                       ▼
Bước 4: Kiểm định giả thuyết (Điều chỉnh xác suất lâm sàng theo định lý Bayes)
                       │
                       ▼
Bước 5: Vòng lặp phản hồi (Tái đánh giá và lặp lại Bước 3 & Bước 4)
                       │
                       ▼
Bước 6: Ra quyết định lâm sàng (Can thiệp điều trị hoặc theo dõi)