Theo mục 2.2 (Dịch tễ học) và 2.3.1 (Nguyên nhân nhiễm trùng):
Nguyên nhân phổ biến nhất nói chung (ước tính 40-80% các trường hợp) là do Virus (ví dụ: Rhinovirus, Coronavirus, Adenovirus, Influenza...).
Nguyên nhân vi khuẩn thường gặp nhất là Liên cầu khuẩn tan huyết nhóm A (GAS - Streptococcus pyogenes). Đây là nguyên nhân chiếm khoảng 15-30% trường hợp đau họng ở trẻ em (phổ biến nhất ở lứa tuổi 5-15) và 5-15% ở người lớn.