Phần lớn các biến cố quan trọng có nguồn gốc nhiều nguyên nhân phối hợp hơn là do một nguyên nhân cụ thể. Do vậy, để đánh giá đúng, qui trình SEA cần phải đánh giá “bức tranh tổng thể” của sự việc. Một số nhóm nguyên nhân gây biến cố y khoa thường gặp bao gồm:
•    Thiếu thông tin
•    Yếu tố về phía bệnh nhân
•    Yếu tố về phía nhân viên y tế
•    Qui trình làm việc không hoàn hảo