Những trường hợp mất ngủ mạn tính có căn nguyên thể chất:
Các bệnh lý đau hoặc viêm (ung thư, bệnh lý thấp, …),
Bệnh lý thần kinh (bệnh Parkinson, sa sút trí tuệ, …),
Ngộ độc (rượu, …).

Mất ngủ mạn tính căn nguyên tâm thần – tâm lý:
Rối loạn tính khí: trầm cảm, trạng thái hưng cảm,
Rối loạn lo âu,
Tâm thần,
Sa sút trí tuệ, 
Đảo ngược chu kỳ ngày-đêm.