Trên cơ sở các ý kiến của các phản biện viên, ban biên tập sẽ đưa ra quyết định cuối cùng. Các quyết định này được hiển thị tại góc bên phải của giao diện quy trình.

Các tùy chọn bao gồm:

• Yêu cầu chỉnh sửa: Tác giả cần thực hiện các chỉnh sửa theo yêu cầu của ban biên tập và các phản biện viên, sau đó gửi lại bản thảo đã chỉnh sửa. Ban biên tập sẽ quyết định xem có cần thiết phải mở một vòng phản biện mới hay không.
• Chấp nhận bản thảo: Với quyết định này, bản thảo sẽ được chuyển sang giai đoạn 3: Biên tập.
• Từ chối bản thảo: Quyết định này đồng nghĩa với việc bản thảo đã không đáp ứng các yêu cầu của các phản biện viên và ban biên tập. Quyết định này sẽ chấm dứt quy trình phản biện và chuyển công việc này vào mục lưu trữ (được xem là đã hoàn tất).

Biên tập viên vẫn có thể thu hồi quyết định này nếu có thêm thông tin phù hợp. Khi quyết định được thu hồi, trạng thái của công việc sẽ được khôi phục về thời điểm trước khi bị từ chối.