Các lỗ thủng vách ngăn mũi có thể xảy ra do nhiều nguyên nhân khác nhau. Nguyên nhân phổ biến nhất là phẫu thuật vách ngăn mũi trước đó. Ngoài ra, các yếu tố như ngoáy mũi thường xuyên, đốt vách ngăn mũi nhiều lần trong điều trị chảy máu cam, tiếp xúc với hóa chất công nghiệp như crom, lạm dụng cocaine, u hạt mũi hay nhiễm trùng mãn tính như giang mai hoặc lao (mặc dù khá hiếm gặp hiện nay) cũng có thể gây ra tổn thương này. Những lỗ thủng nhỏ thường không gây triệu chứng rõ rệt, nhưng có thể tạo ra tiếng huýt sáo khi thở bằng mũi. Trong khi đó, các lỗ thủng lớn hơn có thể gây ra chảy máu mũi, cảm giác đau, hoặc cảm giác khó thở do sự thay đổi cấu trúc của khoang mũi. Tình trạng này cần được chẩn đoán và điều trị kịp thời để tránh các biến chứng nghiêm trọng.